La historia de Chiquititas cuenta la historia de Magalí Garcés, una exitosa empresaria que dirige una empresa de manzanas llamada "Alto Valle". Sin embargo, en la vida de Magalí han habido alegrías y tristezas. La más grande de ellas fue el perder a su hija recién nacida, ya que su padre, Víctor Garcés, un importante hombre de reconocido nombre en su pueblo, se la arrebató y la llevó a un orfanato del sur del país sin el consentimiento de su hija y decirle que había muerto. Desafortunadamente para Víctor, Magalí se entera que su hija está viva gracias a una informante secreta, Rosalía Perez, quien envió una llamada, pero no alcanzó a informar el sexo y la ubicación del bebé.
En una donación en el orfanato de los Demont, una familia de aristócratas arrogantes y despiadados, a los que lo único que les importa es el dinero y que vieron en el orfanato una forma de poder subsistir, conoce a Luna, una de las más pequeñas de las hospedadas, y al creer que ella podría posiblemente ser su hija, decide recurrir a un recurso especial: camuflarse como Lilí, la supuesta prima-hermana de Magalí, una mujer alocada y llena de risas que convertirá el horrible orfanato en una casa de sueños y alegrías.
Además de Luna, se encuentran diferentes chicos que están en el hogar por distintas razones:
- Marcel El hijo mayor de los Demont, quien quiere a Agustina, al principio por puro interés, pero va cambiando poco a poco, sin embargo, nunca tendrá su amor.
- Thiara La hija menor de los Demont, es el clon perfecto de la mala. Se cree la reina del universo.
- Nano es un genio científico en empaque pequeño.
- Anita es una santa en miniatura, por haberse criado en un convento.
- Petardo es una bomba a punto de estallar,le encanta jugar futbol y es el hermano perdido de vale.
- Fercho es el mejor amigo de Pertardo. Le encanta la música
- Julepe es muy miedoso y tímido, pero es muy simpático.
- Pulgas es uno de los más grandes,es el mejor amigo de Tábano y el más sucio, a propósito.
- Vale por tantas cosas que ha perdido, es la más fría de los huérfanos, y espera que la adopten rápido.
- Miki vive en sus propios cuentos de hadas, lo que la hace sufrir cada vez que se desilusiona.
- Paula y Tábano son dos hermanos que huyeron del maltrato en su casa, y vivieron en la calle por mucho tiempo, hasta que fueron remitidos al hogar; a pesar de sus actitudes rudas, son totalmente blandos por dentro.
- Agus no es huérfana, pero vive en el hogar porque sus padres (unos multimillonarios que se fueron a vacaciones en Perú) dejaron a cargo a los Demont de ella durante su ausencia, pero se supo una terrible noticia que la podría dejar huérfana.
Los Demont están interesados en su dinero, pero no sólo ellos, muchas otras personas la tratan por su fortuna, pero ella encuentra en los huérfanos, personas que la quieren por lo que es.